RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 LRRC19Q9H756 370 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GREM2Q9H772 168 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CHST12Q9NRB3 414 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SELENONQ9NZV5 590 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NAGPAQ9UK23 515 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 LZTS1Q9Y250 596 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TIMM22Q9Y584 194 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 A0A087X0T9 212 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 E2F8A0AVK6 867 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SYCE1LA8MT33 242 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM189A1O60320 539 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ADAM23O75077 832 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SULT1C4O75897 302 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 BMP10O95393 424 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FGGP02679 453 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM228BP0C875 321 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RSPH10BP0C881 870 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FOXN2P32314 431 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FDFT1P37268 417 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CETN2P41208 172 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 STK4Q13043 487 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SNAPC2Q13487 334 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GRAPQ13588 217 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PHKG1Q16816 387 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TTC27Q6P3X3 843 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CABP7Q86V35 215 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TRABD2AQ86V40 505 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TTLL6Q8N841 843 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FANCBQ8NB91 859 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RFFLQ8WZ73 363 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MAML1Q92585 1016 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 YME1L1Q96TA2 773 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DOK1Q99704 481 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HIPK3Q9H422 1215 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 EBF3Q9H4W6 596 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PIM2Q9P1W9 311 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AP4S1Q9Y587 144 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PSME4Q14997 1843 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SBF1O95248 1867 aa7.43□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM25EA8MYX2 175 aa7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TLR2O60603 784 aa7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MMP20O60882 483 aa7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FKBP9O95302 570 aa7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CBX6O95503 412 aa7.42□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MYL4P12829 197 aa7.42□□□□□ -1.22
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