RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ST7Q9NRC1 585 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 STC2O76061 302 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 OPRD1P41143 372 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ACADSBP45954 432 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 BPIFB4P59827 614 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 COG7P83436 770 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 NHLH1Q02575 133 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 UBXN1Q04323 297 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MTAPQ13126 283 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GAS6Q14393 721 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SYCP1Q15431 976 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZNB5 142 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CD101Q93033 1021 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MIS12Q9H081 205 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 LHX5Q9H2C1 402 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 F8VZ95 297 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 KLKB1P03952 638 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.16e-7■□□□□ 10
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ACTB-211ENST00000480301 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A8A0AV02 714 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 E5RJQ4 531 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ADH1CP00326 375 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 EGFP01133 1207 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 LTFP02788 710 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 HMBSP08397 361 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CYP11B1P15538 503 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 KRT9P35527 623 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZS52 159 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 TMEM25Q86YD3 366 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 PASD1Q8IV76 773 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 RNF139Q8WU17 664 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 IER2Q9BTL4 223 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 LAMTOR5O43504 91 aa21.91■■□□□ 1.1
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ACTB-211ENST00000480301 ADH5P11766 374 aa21.91■■□□□ 1.1
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ACTB-211ENST00000480301 SLC6A11P48066 632 aa21.91■■□□□ 1.1
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ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 C12orf40Q86WS4 652 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 EXOC4Q96A65 974 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CPXM1Q96SM3 734 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CBX8Q9HC52 389 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 TEX33O43247 280 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G5P39877 138 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GAD2Q05329 585 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA1Q92805 767 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 FAM122AQ96E09 287 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 DCLK3Q9C098 648 aa21.9■■□□□ 1.1
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.89■■□□□ 1.1
ACTB-211ENST00000480301 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SP9P0CG40 484 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NEK11Q8NG66 645 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PLD4Q96BZ4 506 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PHOX2BQ99453 314 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.89■■□□□ 1.09
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