RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478196.6

RPS27A-208, Transcript of ribosomal protein S27a, human

TSL 2

Gene RPS27A, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS27A-208	ENST00000478196	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RXRA	P19793	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ANAPC15	P60006	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCL14	Q16627	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TRIB2	Q92519	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ASTN1	O14525	1302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ERICH2	A1L162	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	STRN	O43815	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBED4	O75132	1171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC25A27	O95847	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PGK2	P07205	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CYP2B6	P20813	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ADORA2A	P29274	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RCAN1	P53805	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PRMT2	P55345	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CLRN1	P58418	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCNA1	P78396	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GHRHR	Q02643	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PLS1	Q14651	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	KIF22	Q14807	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	COA7	Q96BR5	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PIGS	Q96S52	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	MROH8	Q9H579	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PRSS38	A1L453	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBTB5	O15062	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBTB43	O43298	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	GAS7	O60861	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	LARGE1	O95461	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CALM1	P0DP23	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CALM2	P0DP24	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CALM3	P0DP25	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	FCER1A	P12319	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ALAS1	P13196	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	PSMA5	P28066	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	HOXD10	P28358	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	COPB2	P35606	906 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	RGS2	P41220	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS27A-208	ENST00000478196	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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