RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476646.5

NFIA-209, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 3

Gene NFIA, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-209	ENST00000476646	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	HSPH1	Q92598	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	COPS5	Q92905	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62	9e-7	■■■■■ 29.8
NFIA-209	ENST00000476646	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TBCB	Q99426	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646		A0A1B0GUA9	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	LIAS	O43766	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TSPAN1	O60635	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CST8	O60676	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CILP	O75339	1184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SUN1	O94901	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TTC4	O95801	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZBED1	O96006	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ABHD2	P08910	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TSHR	P16473	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TGM2	P21980	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PCK1	P35558	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ADH7	P40394	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MAGEA4	P43358	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MAGEA9	P43362	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ASPA	P45381	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TAF6	P49848	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	NDST1	P52848	882 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	BCAT1	P54687	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	RAD23B	P54727	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CDH6	P55285	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	HUNK	P57058	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	DYNLT1	P63172	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GPLD1	P80108	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GRB14	Q14449	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PCSK7	Q16549	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	CEP120	Q8N960	986 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFIA-209	ENST00000476646	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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