RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 KRT9P35527 623 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 CXCL12P48061 93 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 GALK1P51570 392 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 DAOAP59103 153 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZNF445P59923 1031 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 FOXK2Q01167 660 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 BEND5Q7L4P6 421 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 PLD4Q96BZ4 506 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 STK33Q9BYT3 514 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 VPS16Q9H269 839 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TMEM51Q9NW97 253 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 BECN2A8MW95 431 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TULP2O00295 520 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TBX18O95935 607 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 LTFP02788 710 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ADH5P11766 374 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 LCP1P13796 627 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 PGFP49763 221 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 KCNMA1Q12791 1236 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 EFEMP1Q12805 493 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MTAPQ13126 283 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 E2F5Q15329 346 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TMEM110Q86TL2 294 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MIB1Q86YT6 1006 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 PNKPQ96T60 521 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MIS12Q9H081 205 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ST7Q9NRC1 585 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TAB2Q9NYJ8 693 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.97□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 COL4A3Q01955 1670 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 A0A0A0MRY4 1105 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 E7ENQ6 273 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 STC2O76061 302 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 LATS1O95835 1130 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 GLI1P08151 1106 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 SP9P0CG40 484 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZNF18P17022 549 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 HOXA6P31267 233 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZNF165P49910 485 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 COPB1P53618 953 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 TPM4P67936 248 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 GJB7Q6PEY0 223 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZNB5 142 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ZNF677Q86XU0 584 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 ACDQ96AP0 544 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 MARK1Q9P0L2 795 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-211ENST00000476336 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 LGALS16A8MUM7 142 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 GREM1O60565 184 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 CYBBP04839 570 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 APODP05090 189 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 CCDC172P0C7W6 258 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 IRF1P10914 325 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 CLCN1P35523 988 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 GRIA2P42262 883 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF4P43489 277 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 RGS7P49802 495 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 UBXN1Q04323 297 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 RING1Q06587 406 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 MTA1Q13330 715 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 NNTQ13423 1086 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 NCAPHQ15003 741 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-211ENST00000476336 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms