RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 IQUBQ8NA54 791 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 BHMTQ93088 406 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 OTUB2Q96DC9 234 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 CYLDQ9NQC7 956 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 EHD2Q9NZN4 543 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-206ENST00000474188 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SH3BP5O60239 455 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 YEATS4O95619 227 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HLA-DRAP01903 254 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CFIP05156 583 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SERPINF2P08697 491 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PRR29P0C7W0 189 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PPP3CAQ08209 521 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BIRC3Q13489 604 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GEN1Q17RS7 908 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FYB2Q5VWT5 728 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TMEM215Q68D42 235 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PAGE5Q96GU1 130 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SPACA7Q96KW9 195 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CUEDC2Q9H467 287 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 IL21RQ9HBE5 538 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SCML2Q9UQR0 700 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NUMA1Q14980 2115 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP33O14559 1287 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CBFA2T3O75081 653 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PHACTR2O75167 634 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 STC2O76061 302 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TRIM49P0CI25 452 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TRIM49CP0CI26 452 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 RARGP13631 454 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 IL12RB1P42701 662 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 KIF11P52732 1056 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 INCA1Q0VD86 236 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 FUT11Q495W5 492 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 C1orf216Q8TAB5 229 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SORCS1Q8WY21 1168 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 SEMA4DQ92854 862 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BBS2Q9BXC9 721 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 COMMD8Q9NX08 183 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 USP3Q9Y6I4 520 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TULP2O00295 520 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 AP5Z1O43299 807 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 NR3C1P04150 777 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 COPAP53621 1224 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 MFAP3P55082 362 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 AMPD3Q01432 767 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 ENPP2Q13822 863 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 CHPFQ8IZ52 775 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-206ENST00000474188 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms