RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM170A	A1A519	330 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902		E5RJQ4	531 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NCAM2	O15394	837 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SOX5	P35711	763 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	AMPD2	Q01433	879 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ARID5A	Q03989	594 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PDCL	Q13371	301 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SCML4	Q8N228	414 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ZNF276	Q8N554	614 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	WBP2	Q969T9	261 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PHOX2B	Q99453	314 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	LHX5	Q9H2C1	402 aa		18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SLC12A8	A0AV02	714 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LTF	P02788	710 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	COG7	P83436	770 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FANCC	Q00597	558 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PON2	Q15165	354 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		18.58	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GTH6	734 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902		H0Y858	1186 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GJA4	P35212	333 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	UBASH3A	P57075	661 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	JAM2	P57087	298 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SNX16	P57768	344 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TMEM110	Q86TL2	294 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CPXM1	Q96SM3	734 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		18.57	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SHISA7	A6NL88	538 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CAPN9	O14815	690 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	STC2	O76061	302 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	MME	P08473	750 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NCAM1	P13591	858 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DHCR24	Q15392	516 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	HTR3D	Q70Z44	454 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	EXOC4	Q96A65	974 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	OTUB2	Q96DC9	234 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		18.56	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ADH1C	P00326	375 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CYP17A1	P05093	508 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NR1I3	Q14994	352 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ANO4	Q32M45	955 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	RNF214	Q8ND24	703 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DCLK3	Q9C098	648 aa		18.55	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQC6	194 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ADH5	P11766	374 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GALK1	P51570	392 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CDR2	Q01850	454 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LRRC32	Q14392	662 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ZNF677	Q86XU0	584 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CHFR	Q96EP1	664 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		18.54	■□□□□ 0.56

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