RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006		Q96MF0	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006		B4DLN1	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006		H0Y3Z8	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	AHCYL1	O43865	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM63A	O94886	807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	GPANK1	O95872	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PRKCB	P05771	671 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	SBK3	P0C264	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	CKB	P12277	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	CHM	P24386	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006		Q8NA96	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT10-208	ENST00000463006	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PCDH17	O14917	1159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CCP110	O43303	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DNPH1	O43598	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC43A1	O75387	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ANXA1	P04083	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ALAS1	P13196	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TPH1	P17752	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MST1	P26927	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC6A4	P31645	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CXCR5	P32302	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNS	P34059	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	STAT1	P42224	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NPTX2	P47972	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	POLD2	P49005	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PTH2R	P49190	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CPT1A	P50416	773 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VAV2	P52735	878 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	BCAT1	P54687	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006		Q6ZNX1	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM170A	A1A519	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006		M0QYG6	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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