RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460227.4

MECP2-206, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 5

Gene MECP2, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-206	ENST00000460227	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NCAM1	P13591	858 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FECH	P22830	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MRE11	P49959	708 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DPYSL4	O14531	572 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MDM4	O15151	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GREM1	O60565	184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	HSF2BP	O75031	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	PSMC3	P17980	439 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	COG7	P83436	770 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TDG	Q13569	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GSE1	Q14687	1217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	ZNF77	Q15935	545 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	WBP2	Q969T9	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CAPN9	O14815	690 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GRAP2	O75791	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	KRT3	P12035	628 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	RRM1	P23921	792 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NOS2	P35228	1153 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MATK	P42679	507 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NACA2	Q9H009	215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CHAD	O15335	359 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	AKR1B10	O60218	316 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	GPC5	P78333	572 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	USP4	Q13107	963 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MTF1	Q14872	753 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	NPY6R	Q99463	290 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MECP2-206	ENST00000460227	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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