RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM66	O15016	1216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ASMTL	O95671	621 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TH	P07101	528 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CD48	P09326	243 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ETS1	P14921	441 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	L1CAM	P32004	1257 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2C18	P33260	490 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HCAR3	P49019	387 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HUNK	P57058	714 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NKX3-2	P78367	333 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SCML4	Q8N228	414 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758		C9IYK1	514 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYB561D2	O14569	222 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GABRD	O14764	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD3	O43242	534 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	IL1B	P01584	269 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ODC1	P11926	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MX2	P20592	715 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ADORA2B	P29275	332 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC8A1	P32418	973 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINB6	P35237	376 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SCTR	P47872	440 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SULT1E1	P49888	294 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GDF10	P55107	478 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HDAC4	P56524	1084 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GJA9	P57773	515 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT8B	Q93098	351 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	VAT1	Q99536	393 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN18	Q99952	460 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN9	O14815	690 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TREH	O43280	583 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TYROBP	O43914	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GRAP2	O75791	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	LCP1	P13796	627 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT4	P19013	534 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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