RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438979.6

ABCC5-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 5, human

TSL 5

Gene ABCC5, Length 821 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC5-208	ENST00000438979	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	JUP	P14923	745 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ABCD1	P33897	745 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	DGKG	P49619	791 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	COPA	P53621	1224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	IL9R	Q01113	521 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TLE3	Q04726	772 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GRIN1	Q05586	938 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	RTP5	Q14D33	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	BHMT	Q93088	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FAM92A	A1XBS5	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CAPN9	O14815	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ARHGAP6	O43182	974 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	OXTR	P30559	389 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	DDIT3	P35638	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TUB	P50607	506 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CASP5	P51878	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	IGSF8	Q969P0	613 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	HVCN1	Q96D96	273 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	NUP58	Q9BVL2	599 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TACC1	O75410	805 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GART	P22102	1010 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PRKCH	P24723	683 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ACSL1	P33121	698 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CTSK	P43235	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CCT8	P50990	548 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SLC5A3	P53794	718 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	STARD3	Q14849	445 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SNX19	Q92543	992 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CALML4	Q96GE6	196 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CLMP	Q9H6B4	373 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	MYLK	Q15746	1914 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SLC26A4	O43511	780 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	TLR5	O60602	858 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	UBA7	P41226	1012 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	GRIA4	P48058	902 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	MFAP3	P55082	362 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CXADR	P78310	365 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	SHB	Q15464	509 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCC5-208	ENST00000438979	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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