RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 RPS6KB1P23443 525 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MPP5Q8N3R9 675 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ELP5Q8TE02 316 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PIGKQ92643 395 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RMI1Q9H9A7 625 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.63□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 BTN3A1O00481 513 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 DSCR9P59020 149 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MVB12AQ96EY5 273 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.62□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A0G2JK05 382 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 UGDHO60701 494 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SOCS5O75159 536 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 KATNA1O75449 491 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RASAL1O95294 804 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CD19P15391 556 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 GATMP50440 423 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ARFIP2P53365 341 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MTA1Q13330 715 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TRILQ7L0X0 811 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TMX1Q9H3N1 280 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.61□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 A8MVJ9 347 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM233B4DJY2 109 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PODXLO00592 558 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 LDB3O75112 727 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ALDH2P05091 517 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ADRA1DP25100 572 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 JAK3P52333 1124 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 FGL2Q14314 439 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 RTL10Q7L3V2 364 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CGRRF1Q99675 332 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 STAP2Q9UGK3 403 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 SCN5AQ14524 2016 aa4.6□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 H0YGN5 161 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PRAMEF2O60811 474 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 HGFP14210 728 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 INSCQ1MX18 579 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 CHPFQ8IZ52 775 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 P2RY11Q96G91 374 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 VPS50Q96JG6 964 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 THSD1Q9NS62 852 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 PLK2Q9NYY3 685 aa4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP9YP28-201ENST00000435142 TBC1D4O60343 1298 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ST6GAL1P15907 406 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PGDP52209 483 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 MORC1Q86VD1 984 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 LPAR1Q92633 364 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.58□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A088AWK7 358 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 AGPSO00116 658 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 IL33O95760 270 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 TFEBP19484 476 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC13A2Q13183 592 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 RAB32Q13637 225 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 ST3GAL2Q16842 350 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.57□□□□□ -1.68
USP9YP28-201ENST00000435142 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms