RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 NME7Q9Y5B8 376 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 KNTC1P50748 2209 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 A0A1B0GTW7 788 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GFRA2O00451 464 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ZNF202O95125 648 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ZNF883P0CG24 379 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MAOBP27338 520 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 HTR3DQ70Z44 454 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 COL26A1Q96A83 441 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TRIM9Q9C026 710 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PANK4Q9NVE7 773 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 IL37Q9NZH6 218 aa20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CLDN5O00501 218 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CACNG3O60359 315 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CD6P30203 668 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 AFMP43652 599 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 UBE2HP62256 183 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ASIC1P78348 528 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PAGE5Q96GU1 130 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 KCNK16Q96T55 309 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 NACA2Q9H009 215 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 COMMD8Q9NX08 183 aa20.53■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 A8MXQ7 604 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PRRT4C9JH25 899 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TNNC1P63316 161 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 WBP2Q969T9 261 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 BBS2Q9BXC9 721 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CD93Q9NPY3 652 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MARK1Q9P0L2 795 aa20.52■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 FAM92AA1XBS5 289 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 TYRP14679 529 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 CDC6Q99741 560 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 RAD54BQ9Y620 910 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 PTPRBP23467 1997 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 ATP8B3O60423 1300 aa20.51■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 MEI4A8MW99 385 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 GREM1O60565 184 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 CER1O95813 267 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 IRF1P10914 325 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 ZNF132P52740 706 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 SLC5A3P53794 718 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 UNC13DQ70J99 1090 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 TIGD1Q96MW7 591 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 GAREM1Q9H706 876 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 KALRNO60229 2985 aa20.5■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 WASH3PC4AMC7 463 aa20.49■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 DKK1O94907 266 aa20.49■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 CISD3P0C7P0 127 aa20.49■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 NCAM1P13591 858 aa20.49■□□□□ 0.87
LTB-210ENST00000429299 TNNI1P19237 187 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms