RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 GREM1O60565 184 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 EGFP01133 1207 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2G5P39877 138 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF165P49910 485 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 UBXN1Q04323 297 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CCINQ13939 588 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GAS6Q14393 721 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 Q6ZS52 159 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PHOX2BQ99453 314 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SMTNL1A8MU46 457 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 LGALS16A8MUM7 142 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 STC2O76061 302 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A11P48066 632 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 COG7P83436 770 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SYCP1Q15431 976 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GAB4Q2WGN9 574 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SCML4Q8N228 414 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 IRGQQ8WZA9 623 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 OTUB2Q96DC9 234 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 STK33Q9BYT3 514 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GANQ9H2C0 597 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO21O94952 628 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ADH1CP00326 375 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ADH5P11766 374 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT9P35527 623 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 OPRD1P41143 372 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ACADSBP45954 432 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 BPIFB4P59827 614 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 MEA1Q16626 185 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 ANO4Q32M45 955 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM25Q86YD3 366 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 STK32AQ8WU08 396 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOC4Q96A65 974 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHB6O15197 1021 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 LTFP02788 710 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 KLKB1P03952 638 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SP9P0CG40 484 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TSSK4Q6SA08 328 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 NAT16Q8N8M0 369 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA1Q92805 767 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 E5RJQ4 531 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 DRD1P21728 446 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GAD2Q05329 585 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PDCLQ13371 301 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF3Q5VWG9 929 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TPGS1Q6ZTW0 290 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 C12orf40Q86WS4 652 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM170AA1A519 330 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 F8VZ95 297 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP11B1P15538 503 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 Q6ZNB5 142 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM110Q86TL2 294 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 DENND1CQ8IV53 801 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX5Q9H2C1 402 aa26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1-202ENST00000425695 MSI1O43347 362 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF40O75150 1001 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 GFPT2O94808 682 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SATB1Q01826 763 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 IQCB1Q15051 598 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NEK11Q8NG66 645 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 BHMTQ93088 406 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CPXM1Q96SM3 734 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 DCLK3Q9C098 648 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX33O43247 280 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 FYNP06241 537 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NCAM1P13591 858 aa26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms