RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 RGL2O15211 777 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 HBP1O60381 514 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM63AO94886 807 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 JCHAINP01591 159 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 POLBP06746 335 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 VDRP11473 427 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ETS2P15036 469 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PKNOX1P55347 436 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 WNT7BP56706 349 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PLIN5Q00G26 463 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 OGDHQ02218 1023 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 FSTL1Q12841 308 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 CHST12Q9NRB3 414 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 AAASQ9NRG9 546 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SETD4Q9NVD3 440 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.96□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 TM9SF1O15321 606 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RALBP11234 206 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PMLP29590 882 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CDKN2BP42772 138 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PLK1P53350 603 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 MSS51Q4VC12 460 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 METTL7BQ6UX53 244 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF139Q8WU17 664 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 IL1R2P27930 398 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RABGGTBP53611 331 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGAP8P85298 464 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 GBE1Q04446 702 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC34A1Q06495 639 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 BBS12Q6ZW61 710 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 STKLD1Q8NE28 680 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CDT1Q9H211 546 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 APPL1Q9UKG1 709 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 AK5Q9Y6K8 562 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNA2P16389 499 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 DDIASQ8IXT1 998 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PTPRN2Q92932 1015 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF181Q9P0P0 153 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SLIT2O94813 1529 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 MYO9BQ13459 2157 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PEX1O43933 1283 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 SPAG6O75602 509 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 IL18RAPO95256 599 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMG1O95456 288 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2C8P10632 490 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CPA3P15088 417 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 USP4Q13107 963 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 POU6F1Q14863 301 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF220Q5VTB9 566 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD42-202ENST00000393389 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms