RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ENKURQ8TC29 256 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 COG1Q8WTW3 980 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD6Q96NE9 622 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HINFPQ9BQA5 517 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CSF2RAP15509 400 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PCSK6P29122 969 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CCR1P32246 355 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ6P48051 423 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MADCAM1Q13477 382 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GALEQ14376 348 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPAQ15257 358 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGD6Q17RP2 521 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HECTD3Q5T447 861 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RESP18Q5W5W9 173 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO30Q8TB52 745 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BAP1Q92560 729 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DPF2Q92785 391 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF21AQ96BD5 680 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TNIP3Q96KP6 325 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CLPBQ9H078 707 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GIN1Q9NXP7 522 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DERAQ9Y315 318 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MYH7P12883 1935 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C4AP0C0L4 1744 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 AP3D1O14617 1153 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN3O15551 220 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTM2P28161 218 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT6CP48668 564 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 XKR3Q5GH77 459 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL23Q86XA0 190 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR11A4FU01 709 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 ALBP02768 609 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HNMTP50135 292 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ERVK-21P61565 698 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADRM1Q16186 407 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 USP51Q70EK9 711 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GTQ1 180 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TSC22D2O75157 780 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYND11Q15326 602 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 XKR9Q5GH70 373 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.05□□□□□ -1.28
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