RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PTK2BQ14289 1009 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SPARCL1Q14515 664 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT72Q14CN4 511 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PFKFB4Q16877 469 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND2CQ68D51 928 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CIPCQ9C0C6 399 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX15Q9NRS6 342 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 AOX1Q06278 1338 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 AQP12BA6NM10 295 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS16A8MUM7 142 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 J3KTA2 159 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH17O14917 1159 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NPPBP16860 134 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 INHBEP58166 350 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ICA1Q05084 483 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ12Q14500 433 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ZACNQ401N2 412 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 STYXQ8WUJ0 223 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX18Q96RF0 628 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MMS19Q96T76 1030 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 COX11Q9Y6N1 276 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 H7C1Q1 480 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ASNA1O43681 348 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF5LO75529 589 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 MT-CO3P00414 261 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ANXA6P08133 673 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 DRD1P21728 446 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 DNASE1L3Q13609 305 aa4.5□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 P3H2Q8IVL5 708 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM71BQ8TC56 605 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS45Q9NRW7 570 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ASIC5Q9NY37 505 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DNPH1O43598 174 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF2O60811 474 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 USP1O94782 785 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGA5P08648 1049 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC10P48553 1259 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 GPC5P78333 572 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CFHR3Q02985 330 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TFF2Q03403 129 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3BQ13214 749 aa4.49□□□□□ -1.69
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RABGGTB-202ENST00000370826 GRM4Q14833 912 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC38Q502W7 563 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.49□□□□□ -1.69
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