RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RMI1Q9H9A7 625 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC5O00471 708 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF2O60811 474 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 RPS6KB1P23443 525 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 MTHFSP49914 203 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ARFIP2P53365 341 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 RTL10Q7L3V2 364 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 AGPSO00116 658 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CD19P15391 556 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 USP29Q9HBJ7 922 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 WNT16Q9UBV4 365 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SLC12A2P55011 1212 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SDE2Q6IQ49 451 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 PIGKQ92643 395 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MVB12AQ96EY5 273 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 FZD3Q9NPG1 666 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 STAP2Q9UGK3 403 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 FANCIQ9NVI1 1328 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GUV1 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 A8MVJ9 347 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 H0YGN5 161 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 KATNA1O75449 491 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH2P05091 517 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 GUCY2FP51841 1108 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 DDR1Q08345 913 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 P2RY11Q96G91 374 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 DPH1Q9BZG8 443 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 THSD1Q9NS62 852 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 BTN3A1O00481 513 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 UGDHO60701 494 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SOCS5O75159 536 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 HGFP14210 728 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ST6GAL1P15907 406 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 NPR1P16066 1061 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ADRA1DP25100 572 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 IDUAP35475 653 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CHPFQ8IZ52 775 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MPP5Q8N3R9 675 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 PHF21BQ96EK2 531 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CKAP5Q14008 2032 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 DOCK7Q96N67 2140 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 LDB3O75112 727 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 UMODP07911 640 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 JAK3P52333 1124 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MTA1Q13330 715 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CGRRF1Q99675 332 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.72□□□□□ -1.65
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