RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.49■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 DEPTORQ8TB45 409 aa22.49■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.49■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.194e-7■□□□□ 10.1
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OPN3-201ENST00000366554 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.48■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.48■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 TBC1D12O60347 775 aa22.47■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 PKP2Q99959 881 aa22.47■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.47■■□□□ 1.19
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OPN3-201ENST00000366554 FBXL18Q96ME1 805 aa22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 SUN2Q9UH99 717 aa22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.45■■□□□ 1.19
OPN3-201ENST00000366554 SLC16A4O15374 487 aa22.45■■□□□ 1.19
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