RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PICALMQ13492 652 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM209BQ5JX69 171 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC181Q5TID7 509 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MORN5Q5VZ52 161 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPP9Q86TI2 863 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT73Q86Y46 540 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIC2Q96JB3 615 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX27Q96L92 541 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR24Q96S15 920 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF7Q9UBF6 113 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIC1O00299 241 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSCR3O14972 297 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FYB1O15117 783 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCK2O43639 380 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF2O60811 474 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HARSP12081 509 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGR1P18146 543 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRD1P21728 446 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRB3P28472 473 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PBX1P40424 430 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF81P51508 661 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKQP52824 942 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 AK2P54819 239 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTAPQ13126 283 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FHL3Q13643 280 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOX1Q15067 660 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL31Q6EBC2 164 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RANBP10Q6VN20 620 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF778Q96MU6 729 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERS4Q9HA82 394 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FZD4Q9ULV1 537 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAFFQ9ULX9 164 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM234BA2RU67 622 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBFA2T3O75081 653 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAR3O75815 825 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF18O76093 207 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNSP34059 522 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK3P51956 506 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 JAK3P52333 1124 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC14A1Q13336 389 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 BFSP2Q13515 415 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNASE1L3Q13609 305 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC138Q96M89 665 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms