RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.04■□□□□ 0.16
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PTPRU-201ENST00000345512 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
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PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP8P85298 464 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 TAF12Q16514 161 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 UGP2Q16851 508 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRU-201ENST00000345512 METTL23Q86XA0 190 aa16.02■□□□□ 0.15
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