RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CEACAM1P13688 526 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CD58P19256 250 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 DPP6P42658 865 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 FOXC1Q12948 553 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MYH10P35580 1976 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM24O15164 1050 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GREM1O60565 184 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CILPO75339 1184 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TBX18O95935 607 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 HOXB2P14652 356 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PRCPP42785 496 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 HTR3DQ70Z44 454 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA4DQ92854 862 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 HHLA1C9JL84 531 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PROS1P07225 676 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GABRG2P18507 467 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MAPK8P45983 427 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MXI1P50539 228 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MIB1Q86YT6 1006 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GSDMAQ96QA5 445 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CYLDQ9NQC7 956 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 HCN2Q9UL51 889 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SCML2Q9UQR0 700 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.23■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CYP26A1O43174 497 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 AP5Z1O43299 807 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 STX10O60499 249 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ENGP17813 658 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ITPKAP23677 461 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 NTSR1P30989 418 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 WASP42768 502 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB124Q8NES8 71 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 BBS2Q9BXC9 721 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 OSER1Q9NX31 292 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 RAB20Q9NX57 234 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 WASF3Q9UPY6 502 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CHD6Q8TD26 2715 aa22.22■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PQF6 199 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CACNG3O60359 315 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SMC2O95347 1197 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 C1QTNF9P0C862 333 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TYRP14679 529 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 HOXD12P35452 270 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF394Q53GI3 561 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TTC39CQ8N584 583 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TSG101Q99816 390 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 DUSP16Q9BY84 665 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 MARK1Q9P0L2 795 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.21■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CFIP05156 583 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SPINK2P20155 84 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 KIF11P52732 1056 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SDE2Q6IQ49 451 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CHPFQ8IZ52 775 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB119Q8N690 84 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA20Q8TB22 786 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SMARCE1Q969G3 411 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ACOX2Q99424 681 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 NMUR1Q9HB89 426 aa22.2■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PQH9 124 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms