RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SMAPO00193 183 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 UGT1A9O60656 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 C1QAP02745 245 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH3A1P30838 453 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC125Q86Z20 511 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TTC17Q96AE7 1141 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SETD4Q9NVD3 440 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PAK5Q9P286 719 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TM9SF1O15321 606 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PDGFRBP09619 1106 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 GRM5P41594 1212 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 GBE1Q04446 702 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PDK2Q15119 407 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM110Q86TL2 294 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 BATF3Q9NR55 127 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.99■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DCTN3O75935 186 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 APOL6Q9BWW8 343 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 KATNBL1Q9H079 304 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0G2JND7 137 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 F5H423 210 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 METTL18O95568 372 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ANP32DO95626 131 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC130P13994 396 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ETV4P43268 484 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 NEK3P51956 506 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 LAMB3Q13751 1172 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 NETO2Q8NC67 525 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 VPS11Q9H270 941 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.98■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DPYSL4O14531 572 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TSHRP16473 764 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 BGNP21810 368 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2F1P24903 491 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ADORA2BP29275 332 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 KYAT1Q16773 422 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 C2CD2LO14523 706 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SMPD1P17405 629 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TGM2P21980 687 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 AKAP5P24588 427 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 LMO2P25791 158 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 GRIA1P42261 906 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 FYB2Q5VWT5 728 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 MPP5Q8N3R9 675 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 RTP4Q96DX8 246 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 APOPT1Q96IL0 206 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 FAM167BQ9BTA0 163 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 HESX1Q9UBX0 185 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.97■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 LCP1P13796 627 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 BMPR2Q13873 1038 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 VTA1Q9NP79 307 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 PLXNB2O15031 1838 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 A8MXQ7 604 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ADCY6O43306 1168 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms