RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PCED1BQ96HM7 432 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 OLFM3Q96PB7 478 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SLC9A7Q96T83 725 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SYT15Q9BQS2 421 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PPCSQ9HAB8 311 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PATJQ8NI35 1801 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CHADO15335 359 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DGKIO75912 1065 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 FBXO21O94952 628 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CCT5P48643 541 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ACLYP53396 1101 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SLC18A1P54219 525 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 BCAR1P56945 870 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DAOAP59103 153 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SEMA3BQ13214 749 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 HIF1AQ16665 826 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 LHX8Q68G74 356 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 FAM35AQ86V20 835 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ACBD6Q9BR61 282 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 I6L893 689 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 NDUFAB1O14561 156 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 AOC2O75106 756 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 GCATO75600 419 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 FAM200BP0CF97 657 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 GHRP10912 638 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SKIP12755 728 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 RBL1P28749 1068 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 GBE1Q04446 702 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 GRIK3Q13003 919 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 MBTPS1Q14703 1052 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 C4orf22Q6V702 233 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 NTAN1Q96AB6 310 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ADAM2Q99965 735 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CCDC77Q9BR77 488 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 RGS18Q9NS28 235 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PAK5Q9P286 719 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SMIM23A6NLE4 172 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ATP5DP30049 168 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 MAGEA3P43357 314 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TKTL1P51854 596 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ARL4CP56559 192 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SCAPQ12770 1279 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TUSC3Q13454 348 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 QPCTQ16769 361 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 BEND5Q7L4P6 421 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 SRLQ86TD4 932 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TRABD2AQ86V40 505 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 MCUQ8NE86 351 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PGBD4Q96DM1 585 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 UROC1Q96N76 676 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 KCNK16Q96T55 309 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 ETNK2Q9NVF9 386 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DTLQ9NZJ0 730 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGA3-201ENST00000325558 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms