RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASAH2Q9NR71 780 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDIT4Q9NX09 232 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSER1Q9NX31 292 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCSK1NQ9UHG2 260 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFPL2O75678 378 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT7P08729 469 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf120Q5SQS8 335 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC38Q5VT99 294 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP10Q92851 521 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CORO1BQ9BR76 489 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NACA2Q9H009 215 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM51Q9NW97 253 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP18Q9UMW8 372 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX12Q9UMY4 172 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAR1BQ9Y6B6 198 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO16Q9Y6X6 1858 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNK3O14649 394 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FANCGO15287 622 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 URI1O94763 535 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R40P59535 323 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX30Q5VWJ9 437 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM32Q8TC27 787 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMOC2Q9H3U7 446 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZWILCHQ9H900 591 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF840PA6NDX5 716 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR5O60602 858 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF19O95750 216 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN2P17706 415 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCP1P17987 556 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDAC4P56524 1084 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RWDD2BP57060 319 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HECTD3Q5T447 861 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAC4Q86UU9 113 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMB7Q99436 277 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DZANK1Q9NVP4 752 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENDOD1O94919 500 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRR2P28476 465 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC25CP30307 473 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT35Q92764 455 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF34Q969K3 372 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINB11Q96P15 392 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYL4P12829 197 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRLRP16471 622 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFEMP1Q12805 493 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GREB1Q4ZG55 1949 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 BOLA3Q53S33 107 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF276Q8N554 614 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIDD1Q9HB75 910 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO7AQ13402 2215 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMA3Q16787 3333 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 F11P03951 625 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF4P15884 667 aa28.56■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBP50607 506 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEMD2Q8NC56 503 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PBKQ96KB5 322 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM33Q9BZ11 813 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCSER2Q9H7U1 834 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU2F2P09086 479 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCR5P32302 372 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCKSL1P49006 195 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBB2AQ13885 445 aa28.55■■■□□ 2.16
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