RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SERAC1Q96JX3 654 aa20.3■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 NPHS2Q9NP85 383 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.3■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 HACE1Q8IYU2 909 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MAML3Q96JK9 1138 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SNX25Q9H3E2 840 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 GINS2Q9Y248 185 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 RECQL4O94761 1208 aa20.26■□□□□ 0.83
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