RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 IRF1P10914 325 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GZMAP12544 262 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MON1BQ7L1V2 547 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CHP1Q99653 195 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GKN1Q9NS71 199 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 OBP2AQ9NY56 170 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 LEFTY2O00292 366 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GLI1P08151 1106 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 PSMC3P17980 439 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 PTP4A2Q12974 167 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 TDGQ13569 410 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 YAF2Q8IY57 180 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087X0T9 212 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 RTN2O75298 545 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 FAM228BP0C875 321 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF77Q15935 545 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF6Q58WW2 860 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB106AQ8N104 65 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 RIN3Q8TB24 985 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1B10O60218 316 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 HMBSP08397 361 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 USP4Q13107 963 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MTF1Q14872 753 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 BEND5Q7L4P6 421 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC42Q96M95 316 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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HOXD4-201ENST00000306324 NARSO43776 548 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DAB1O75553 588 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GDI1P31150 447 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SCNN1AP37088 669 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CDK17Q00537 523 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 PANX2Q96RD6 677 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TCF3P15923 654 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 RRM1P23921 792 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 MRE11P49959 708 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 COG7P83436 770 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM32Q8TC27 787 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ISCUQ9H1K1 167 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 BRD9Q9H8M2 597 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF263O14978 683 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 GJB6O95452 261 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 GPC5P78333 572 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 SLC18A3Q16572 532 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 TAC4Q86UU9 113 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf20Q8ND61 904 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD4-201ENST00000306324 WBP2Q969T9 261 aa23.31■■□□□ 1.32
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