RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 BNIPLQ7Z465 357 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ROR1Q01973 937 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NME3Q13232 169 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 BFSP2Q13515 415 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 KYNUQ16719 465 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FZD10Q9ULW2 581 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ENPP3O14638 875 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TYMPP19971 482 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TGM2P21980 687 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.67■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 H7C0C1 242 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN9O14815 690 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED1O96006 694 aa23.67■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 ATP1A2P50993 1020 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 MORF4L2Q15014 288 aa23.67■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 ADAM32Q8TC27 787 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TLDC2A0PJX2 215 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM23A6NLE4 172 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF487B1APH4 448 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 CAPN2P17655 700 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NR1D1P20393 614 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DEUP1Q05D60 604 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TCTN1Q2MV58 587 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 OR4Q2P0C623 313 aa23.65■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 TSPY1Q01534 308 aa23.65■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 HOOK3Q86VS8 718 aa23.65■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF37A1IGU5 675 aa23.65■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO1A2P46721 670 aa23.64■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 GBE1Q04446 702 aa23.64■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 CPT1BQ92523 772 aa23.64■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.64■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 USP29Q9HBJ7 922 aa23.64■■□□□ 1.38
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.64■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 RELL1Q8IUW5 271 aa23.64■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 RNF208Q9H0X6 261 aa23.64■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.64■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.64■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 USP3Q9Y6I4 520 aa23.64■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 AMPD1P23109 780 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RBL1P28749 1068 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA4P43358 317 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PCGF5Q86SE9 256 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ABI1Q8IZP0 508 aa23.63■■□□□ 1.37
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