RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 M0QYT0 321 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 MAP10Q9P2G4 905 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 TEX33O43247 280 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 PTPN3P26045 913 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CRYMQ14894 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CDK20Q8IZL9 346 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 IL17RAQ96F46 866 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CPVLQ9H3G5 476 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 VPS28Q9UK41 221 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 BBS4Q96RK4 519 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 USP18Q9UMW8 372 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 A0A087X0T9 212 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CYP7B1O75881 506 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 PDZK1Q5T2W1 519 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 AHI1Q8N157 1196 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 PIPSLA2A3N6 862 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 RAD51BO15315 384 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 HSMCR30P0CW71 290 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 UMPSP11172 480 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 AP1G2O75843 785 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 RBP3P10745 1247 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 MSH3P20585 1137 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 ATP12AP54707 1039 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 MAGEB18Q96M61 343 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 S100A13Q99584 98 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.59□□□□□ -0.87
CUX1-201ENST00000292535 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HS6ST1O60243 411 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZNF862O60290 1169 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 GPR15P49685 360 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PRKAA2P54646 552 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.59□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MYL12BO14950 172 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ITGB3P05106 788 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MAPK9P45984 424 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NR2C2P49116 596 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CASP12Q6UXS9 341 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 BDH2Q9BUT1 245 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SPATA2Q9UM82 520 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 B3GAT3O94766 335 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 LSP1P33241 339 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ARID5BQ14865 1188 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SVOPQ8N4V2 548 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 KYQ8NBH2 561 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 STARD8Q92502 1023 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 STX11O75558 287 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PDE9AO76083 593 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MED26O95402 600 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CYP2B6P20813 491 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 FAM228AQ86W67 206 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 POLD4Q9HCU8 107 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 COPG2Q9UBF2 871 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 VAV1P15498 845 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SERPINB5P36952 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ERFP50548 548 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 EFEMP1Q12805 493 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SETD9Q8NE22 299 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NFYCQ13952 458 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PDE5AO76074 875 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCDC153Q494R4 210 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PIGUQ9H490 435 aa9.58□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms