RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 HAUS8Q9BT25 410 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ATP2A1O14983 1001 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 LYPLA2O95372 231 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ZNF23P17027 643 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CCND2P30279 289 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 NR1D2Q14995 579 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KRT15P19012 456 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KRT35Q92764 455 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.225e-7■■■□□ 15.4
PITX1-201ENST00000265340 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ARMCX1Q9P291 453 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 LCTP09848 1927 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 AQP9O43315 295 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ESRRBO95718 433 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ALDH3B2P48448 385 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ARL4CP56559 192 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PALMDQ9NP74 551 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 POLIQ9UNA4 740 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.68■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD34BA5PLL1 514 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 WDR64B1ANS9 1081 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 TISP43B9A030 160 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 MCF2LO15068 1137 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 C4orf19Q8IY42 314 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 RANBP9Q96S59 729 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CEP44Q9C0F1 390 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 VPS11Q9H270 941 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ACAD9Q9H845 621 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CAPN8A6NHC0 703 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 H3BNX3 289 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CXCL11O14625 94 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CYP2J2P51589 502 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 C21orf59P57076 290 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PTK6Q13882 451 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 HIC1Q14526 733 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KLHL3Q9UH77 587 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 APPL1Q9UKG1 709 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SQORQ9Y6N5 450 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 K7ENM7 598 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KCNA2P16389 499 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PCYT1AP49585 367 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 FSTL1Q12841 308 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 NFIL3Q16649 462 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PAOXQ6QHF9 649 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CENPUQ71F23 418 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 GPRASP2Q96D09 838 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 DMAC2Q9NW81 257 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 WDR81Q562E7 1941 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 UBE4BO95155 1302 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CRTAMO95727 393 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 MARCKSL1P49006 195 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 JAK3P52333 1124 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 SLC5A3P53794 718 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 PSMC5P62195 406 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 KRT76Q01546 638 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 CCNIQ14094 377 aa22.66■■□□□ 1.22
PITX1-201ENST00000265340 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms