RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ADH1CP00326 375 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PON1P27169 355 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 USP8P40818 1118 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MRE11P49959 708 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ADIGQ0VDE8 80 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 DHCR24Q15392 516 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PKDCCQ504Y2 493 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MAMSTRQ6ZN01 415 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 SPEM1Q8N4L4 309 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ZNF276Q8N554 614 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CHFRQ96EP1 664 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.5■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CYP17A1P05093 508 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CXCL12P48061 93 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 STX1AQ16623 288 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 GJB7Q6PEY0 223 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MDM4O15151 490 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MED7O43513 233 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 LCP1P13796 627 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 Q6ZS52 159 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 EGFP01133 1207 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CALCAP01258 141 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 GNA15P30679 374 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 RGS7P49802 495 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 COG7P83436 770 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 EFEMP1Q12805 493 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 FBXO43Q4G163 708 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 HTR3DQ70Z44 454 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MIB1Q86YT6 1006 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PROB1E7EW31 1015 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 TPM2P07951 284 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ADH5P11766 374 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 GAS6Q14393 721 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 MIIPQ5JXC2 388 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 PMF1Q6P1K2 205 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 TSSK4Q6SA08 328 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 HSFY1Q96LI6 401 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 R4GN57 208 aa23.47■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 ATG13O75143 517 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 APBA1Q02410 837 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 GAD2Q05329 585 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 RNF139Q8WU17 664 aa23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYT6-210ENST00000641643 THAP12O43422 761 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 RNF40O75150 1001 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 NRLP54845 237 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 SATB1Q01826 763 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ANO4Q32M45 955 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 WBP2Q969T9 261 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ST7Q9NRC1 585 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.45■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 SHC3Q92529 594 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA1Q92805 767 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 PIK3R2O00459 728 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 OPRD1P41143 372 aa23.44■■□□□ 1.34
SYT6-210ENST00000641643 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms