RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640577.1

SPIN3-242, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-242ENST00000640577 ANKMY2Q8IV38 441 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 DEFB106AQ8N104 65 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 KCNK16Q96T55 309 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FOXP3Q9BZS1 431 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ALOX15BO15296 676 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TCEA3O75764 348 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MAP3K7CLP57077 242 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ROR1Q01973 937 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TFDP2Q14188 446 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 UPP1Q16831 310 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TIGD5Q53EQ6 642 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SYPL2Q5VXT5 272 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 PPIL6Q8IXY8 311 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FAF2Q96CS3 445 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CYLDQ9NQC7 956 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 KRT82Q9NSB4 513 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 F8W810 466 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 NRP1O14786 923 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GPR182O15218 404 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 PIAS1O75925 651 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ACADSBP45954 432 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SNX16P57768 344 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 DSC3Q14574 896 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 DPYSL2Q16555 572 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 QPCTQ16769 361 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ARCQ7LC44 396 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FAM131BQ86XD5 332 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 PCED1BQ96HM7 432 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 H7C0C1 242 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 APOL1O14791 398 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CYP2F1P24903 491 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SCNN1AP37088 669 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MATKP42679 507 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ATP5OP48047 213 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 BCAR1P56945 870 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GPX6P59796 221 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GBE1Q04446 702 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MPP2Q14168 576 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 HIF1AQ16665 826 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 DCAF6Q58WW2 860 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CD300LGQ6UXG3 332 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CROCCP2Q86T23 111 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SMOQ99835 787 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF670Q9BS34 389 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MED10Q9BTT4 135 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CLUHO75153 1309 aa15.99■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GMNCA6NCL1 334 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FAM107AO95990 144 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 FYNP06241 537 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 RBL1P28749 1068 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SP3Q02447 781 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 VSTM1Q6UX27 236 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 HASPINQ8TF76 798 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ADAM2Q99965 735 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SYT15Q9BQS2 421 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 KIF3CO14782 793 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ITGB1P05556 798 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ABHD2P08910 425 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ITGA7Q13683 1181 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 NETO2Q8NC67 525 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 COX16Q9P0S2 106 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 TTC3P53804 2025 aa15.98■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 EBAG9O00559 213 aa15.97■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 KCNN4O15554 427 aa15.97■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF623O75123 536 aa15.97■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 AMHP03971 560 aa15.97■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 GOT1P17174 413 aa15.97■□□□□ 0.15
SPIN3-242ENST00000640577 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms