RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ITM2B	Q9Y287	266 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BNC9	293 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM189A1	O60320	539 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTT1	P30711	240 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT9	P35527	623 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK-21	P61565	698 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	UBXN1	Q04323	297 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DDR2	Q16832	855 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL23	Q86XA0	190 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PASD1	Q8IV76	773 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA4D	Q92854	862 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A4	O43511	780 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR15	P49685	360 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	C2CD6	Q53TS8	623 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP157	Q5JU67	520 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF220	Q5VTB9	566 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD16	Q68DU8	428 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM270	Q6UE05	265 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCK	Q8N0W5	287 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCD	Q96DY2	449 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HAPLN3	Q96S86	360 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	STRA6	Q9BX79	667 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PDP2	Q9P2J9	529 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GLUD1	P00367	558 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MME	P08473	750 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MYBL1	P10243	752 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	BDNF	P23560	247 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CASP14	P31944	242 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ARPC4	P59998	168 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC63	Q05C16	580 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CETN1	Q12798	172 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LSAMP	Q13449	338 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	INA	Q16352	499 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	QPCT	Q16769	361 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT39	Q6A163	491 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CGRRF1	Q99675	332 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ASB7	Q9H672	318 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ANO9	A1A5B4	782 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	IL18RAP	O95256	599 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MYL4	P12829	197 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC130	P13994	396 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GNAZ	P19086	355 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP2F1	P24903	491 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIK1	P39086	918 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTM4	Q03013	218 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DSC1	Q08554	894 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RCN1	Q15293	331 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CNGA4	Q8IV77	575 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC8	Q8TAM2	541 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA20	Q8TB22	786 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35C1	Q96A29	364 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.55	□□□□□ -1.2

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