RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEA3P43357 314 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEA6P43360 314 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 BAG6P46379 1132 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGAP1Q07960 439 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM132DQ14C87 1099 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MOB2Q70IA6 237 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 STK32AQ8WU08 396 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SAR1AQ9NR31 198 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM49D1C9J1S8 452 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 RFPL1O75677 317 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CALB2P22676 271 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PRKCHP24723 683 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINB4P48594 390 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 HDAC4P56524 1084 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ASB7Q9H672 318 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC6O75061 913 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 METTL18O95568 372 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 INHBAP08476 426 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC8A3P57103 927 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CDK16Q00536 496 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 BMPR2Q13873 1038 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 RINLQ6ZS11 566 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PRPSAP2O60256 369 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TSPAN1O60635 241 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 IL1BP01584 269 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CCNFP41002 786 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PHKA2P46019 1235 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC26A2P50443 739 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PPM1NQ8N819 430 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 DPP3Q9NY33 737 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PAK5Q9P286 719 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP69A5D8W1 941 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TGDSO95455 350 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS2P05162 132 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF286BP0CG31 522 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 GRIA1P42261 906 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 KRT81Q14533 505 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TEX44Q53QW1 395 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MMP19Q99542 508 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.87□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CYB561D2O14569 222 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 APOL1O14791 398 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TGM2P21980 687 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 GBE1Q04446 702 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TFDP2Q14188 446 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CRYMQ14894 314 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 USP6NLQ92738 828 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 H0Y3Z8 333 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 HAUS5O94927 633 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ARFIP2P53365 341 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 NAA25Q14CX7 972 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms