RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619831.4

DMD-229, Transcript of dystrophin, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 13,734 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-229	ENST00000619831	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	INPP4B	O15327	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FAM20B	O75063	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CYP7B1	O75881	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	IRF1	P10914	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AKR1D1	P51857	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ECM1	Q16610	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CCRL2	O00421	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF263	O14978	683 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	IDH3B	O43837	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RASSF9	O75901	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AKAP3	O75969	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PCNA	P12004	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PTPN7	P35236	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	BCL10	O95999	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GHR	P10912	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CALB2	P22676	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TIPRL	O75663	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CSNK2B	P67870	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PKN1	Q16512	942 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PROM2	Q8N271	834 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AGL	P35573	1532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HS6ST1	O60243	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MGAT1	P26572	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PEX2	P28328	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TCEA2	Q15560	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AFF2	P51816	1311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831		A8MX80	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ITIH2	P19823	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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