RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TGFB1I1O43294 461 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GAS7O60861 476 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NDST2P52849 883 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AP3B2Q13367 1082 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CHI3L2Q15782 390 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BBS9Q3SYG4 887 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MSS51Q4VC12 460 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TTC13Q8NBP0 860 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 THAP11Q96EK4 314 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 COA1Q9GZY4 146 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GBA3Q9H227 469 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB10O96000 172 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK4P31152 587 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PHKA2P46019 1235 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GCLMP48507 274 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NR1H2P55055 460 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 C21orf59P57076 290 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CTBSQ01459 385 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FAAP100Q0VG06 881 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BNIP3Q12983 259 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SEPT6Q14141 434 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SEZ6Q53EL9 994 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LZTR1Q8N653 840 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC89Q8N998 374 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BANPQ8N9N5 519 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SCAIQ8N9R8 606 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FAM20AQ96MK3 541 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WRNIP1Q96S55 665 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CDH22Q9UJ99 828 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MYPNQ86TC9 1320 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CD48P09326 243 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GLRA2P23416 452 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PHBP35232 272 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ETFBP38117 255 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NOVP48745 357 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NRLP54845 237 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GNA12Q03113 381 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ITGADQ13349 1161 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DLGAP5Q15398 846 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MOB2Q70IA6 237 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 STARD8Q92502 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CLUHO75153 1309 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 I3L4J1 428 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BIRC5O15392 142 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KDM1AO60341 852 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A9O60656 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DGKIO75912 1065 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DPEP1P16444 411 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A6P19224 532 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A1P22309 533 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A4P22310 534 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ANXA13P27216 316 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 UGT1A3P35503 534 aa8.48□□□□□ -1.05
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