RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617199.1

MFGE8-217, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

Gene MFGE8, Length 2,464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-217ENST00000617199 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 FAF2Q96CS3 445 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PAFAH2Q99487 392 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 IPPQ9Y573 584 aa13.37□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 C17orf102A2RUQ5 167 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 HUS1O60921 280 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ASMTLO95671 621 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ACADSBP45954 432 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ARCQ7LC44 396 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SPATA21Q7Z572 469 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ADGRF2Q8IZF7 708 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 DENND1AQ8TEH3 1009 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PCNTO95613 3336 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TAC1P20366 129 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CA4P22748 312 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CYP2F1P24903 491 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 RBL1P28749 1068 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 FOXN2P32314 431 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ELK3P41970 407 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SPARCL1Q14515 664 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 DPYSL2Q16555 572 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 LIMS2Q7Z4I7 341 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TNIP3Q96KP6 325 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.36□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 A0A1W2PPM1 405 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 MAP3K6O95382 1288 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 L1CAMP32004 1257 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 HSFY1Q96LI6 401 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CYTH2Q99418 400 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ABCF3Q9NUQ8 709 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 GSTA1P08263 222 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CYP2B6P20813 491 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 MSH2P43246 934 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 KLC2Q9H0B6 622 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TEX264Q9Y6I9 313 aa13.35□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 KBTBD13C9JR72 458 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TYROBPO43914 113 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PIAS1O75925 651 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 GNAT1P11488 350 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 KRT4P19013 534 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 HUNKP57058 714 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 LILRA4P59901 499 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 MTFR1Q15390 333 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 NME8Q8N427 588 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TOP6BLQ8N6T0 577 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 Q9Y3F1 56 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SPAG6O75602 509 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 HHATQ5VTY9 493 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 CGB2Q6NT52 195 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 OSTM1Q86WC4 334 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 PITPNM3Q9BZ71 974 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SLC40A1Q9NP59 571 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 SLC12A4Q9UP95 1085 aa13.34□□□□□ -0.27
MFGE8-217ENST00000617199 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.33□□□□□ -0.28
MFGE8-217ENST00000617199 AVILO75366 819 aa13.33□□□□□ -0.28
MFGE8-217ENST00000617199 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
MFGE8-217ENST00000617199 ZWINTO95229 277 aa13.33□□□□□ -0.28
MFGE8-217ENST00000617199 HOXC8P31273 242 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms