RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 PRIM2P49643 509 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RUNX1T1Q06455 604 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PTPAQ15257 358 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CNGA3Q16281 694 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 C11orf74Q86VG3 221 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 JADE3Q92613 823 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ISCUQ9H1K1 167 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SCN3BQ9NY72 215 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ZNF410Q86VK4 478 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CCNJLQ8IV13 435 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CNPY3Q9BT09 278 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MYPNQ86TC9 1320 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CAND2O75155 1236 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CCR1P32246 355 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KRT20P35900 424 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CDC16Q13042 620 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KAT2BQ92831 832 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 APPL1Q9UKG1 709 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MST1RQ04912 1400 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 HPGDP15428 266 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ADCYAP1R1P41586 468 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DACT2Q5SW24 774 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 HOMEZQ8IX15 550 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CYGBQ8WWM9 190 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 VPS50Q96JG6 964 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 EPN3Q9H201 632 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RMND5AQ9H871 391 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 STMN3Q9NZ72 180 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FZD1Q9UP38 647 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SERPINB8P50452 374 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RENBPP51606 427 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TERF2Q15554 542 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TMEM120BA0PK00 339 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TSPAN3O60637 253 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DGKIO75912 1065 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 GPC1P35052 558 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TBX4P57082 545 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MTA1Q13330 715 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PPIL2Q13356 520 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 VGLL4Q14135 290 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 LONP2Q86WA8 852 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 EDEM1Q92611 657 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CARD9Q9H257 536 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 PPP1R37O75864 691 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SUPT7LO94864 414 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SCNN1BP51168 640 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SGCGQ13326 291 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms