RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 PSMD6Q15008 389 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ABCG4Q9H172 646 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ECT2Q9H8V3 914 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CDH23Q9H251 3354 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TLR5O60602 858 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RHOBTB3O94955 611 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CYP11A1P05108 521 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CD72P21854 359 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CETN2P41208 172 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ORC1Q13415 861 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CSRP2Q16527 193 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 F8VP50 259 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ATP8B1O43520 1251 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RNF40O75150 1001 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NTSR1P30989 418 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TIE1P35590 1138 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MPLP40238 635 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NLRP12P59046 1061 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TAF10Q12962 218 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PPM1JQ5JR12 505 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MIB1Q86YT6 1006 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LARGE1O95461 756 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CTDNEP1O95476 244 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HMBSP08397 361 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NUDT1P36639 197 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MAPK8P45983 427 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SLC12A3P55017 1021 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SUFUQ9UMX1 484 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CACNA1HO95180 2353 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ANHXE9PGG2 379 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DAPK3O43293 454 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KAT7O95251 611 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KRT83P78385 493 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CENPCQ03188 943 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EFEMP1Q12805 493 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CUL4BQ13620 913 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CHSY1Q86X52 802 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 F5H5T6 163 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CMA1P23946 247 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TNFRSF4P43489 277 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KIF11P52732 1056 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TCHHQ07283 1943 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FOXC1Q12948 553 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SPATA17Q96L03 361 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EBAG9O00559 213 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GUCY2FP51841 1108 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LRRC63Q05C16 580 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HDXQ7Z353 690 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KBTBD6Q86V97 674 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EPSTI1Q96J88 318 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 USP28Q96RU2 1077 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LHX5Q9H2C1 402 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms