RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 POLD2P49005 469 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLS1Q14651 629 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLA1AQ53H76 456 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC15A4Q8N697 577 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VN1R3Q9BXE9 311 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NUAK2Q9H093 628 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FZD3Q9NPG1 666 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRIM36Q9NQ86 728 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF814B7Z6K7 855 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FYB1O15117 783 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPRY2O43597 315 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RGS10O43665 173 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VIL1P09327 827 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HOXB2P14652 356 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HSD3B2P26439 372 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRT71Q3SY84 523 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WASHC2DQ5SRD0 308 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 USP45Q70EL2 814 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MORC1Q86VD1 984 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ELP5Q8TE02 316 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OIT3Q8WWZ8 545 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LPAR1Q92633 364 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIGKQ92643 395 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CTHRC1Q96CG8 243 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VPS50Q96JG6 964 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 USP29Q9HBJ7 922 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MSRB1Q9NZV6 116 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CPA4Q9UI42 421 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRHDEQ9UKU6 1024 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCDHA12Q9UN75 941 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MED16Q9Y2X0 877 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TBX22Q9Y458 520 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SRGAP2O75044 1071 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD19P15391 556 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TIRAPP58753 221 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ITKQ08881 620 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PGS1Q32NB8 556 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF783Q6ZMS7 281 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UEVLDQ8IX04 471 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MPP5Q8N3R9 675 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM71DQ8N9W8 422 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WBP2Q969T9 261 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FCRL5Q96RD9 977 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TM2D2Q9BX73 214 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMX1Q9H3N1 280 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MYO6Q9UM54 1294 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A087WWL8 130 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A087WYN8 130 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DENND3A2RUS2 1198 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H0YGN5 161 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EXOC5O00471 708 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GABRDO14764 452 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RASAL1O95294 804 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TFEBP19484 476 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UQCRC1P31930 480 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 JAK3P52333 1124 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DSCR9P59020 149 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MTA1Q13330 715 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DLGAP5Q15398 846 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTPN21Q16825 1174 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ST3GAL2Q16842 350 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 INSCQ1MX18 579 aa2.12□□□□□ -2.07
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms