RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HES6	Q96HZ4	224 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SCLY	Q96I15	445 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77	9e-11	■□□□□ 8.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RASSF9	O75901	435 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BDNF	P23560	247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATIC	P31939	592 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ETFB	P38117	255 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CENPC	Q03188	943 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BMPR2	Q13873	1038 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232		A8MX80	341 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MICAL2	O94851	1124 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CALB1	P05937	261 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RANBP1	P43487	201 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GATM	P50440	423 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ADIG	Q0VDE8	80 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PMF1	Q6P1K2	205 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAF2	Q96CS3	445 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SRRD	Q9UH36	339 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IPP	Q9Y573	584 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FGFR1	P11362	822 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	AMPD1	P23109	780 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	AXL	P30530	894 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SDC4	P31431	198 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IRF5	Q13568	498 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC45	Q96CN5	670 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAM2	Q99965	735 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CARD9	Q9H257	536 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IRF1	P10914	325 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RAD23B	P54727	409 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MTA1	Q13330	715 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CACUL1	Q86Y37	369 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX27	Q96L92	541 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	DFFA	O00273	331 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYB561D2	O14569	222 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HMGCR	P04035	888 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PYGL	P06737	847 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CA4	P22748	312 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MIP	P30301	263 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	STX2	P32856	288 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	EXT2	Q93063	718 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RASA4B	C9J798	803 aa		10.21	□□□□□ -0.77

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