RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 STKLD1Q8NE28 680 aa20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 NELFBQ8WX92 580 aa20.35■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.35■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 PFKLP17858 780 aa20.33■□□□□ 0.85
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SGMS1-208ENST00000608287 MYRFLQ96LU7 910 aa20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 CEP63Q96MT8 703 aa20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.33■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CLDN5O00501 218 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP33O14559 1287 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM66O15016 1216 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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