RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-225	ENST00000598539	HDC	P19113	662 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ATIC	P31939	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ZNF165	P49910	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ZNF445	P59923	1031 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	MYL7	Q01449	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	KRT39	Q6A163	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539		K7EQS6	105 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PMM2	O15305	246 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	HUS1	O60921	280 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	CLSTN1	O94985	981 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ADH1C	P00326	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	KRT19	P08727	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	P4HA1	P13674	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PTGER3	P43115	390 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	WNT7B	P56706	349 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	SCAP	Q12770	1279 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ZACN	Q401N2	412 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	TAF4B	Q92750	862 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	PNKP	Q96T60	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FCHO1-225	ENST00000598539	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	PI4KA	P42356	2102 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	PCSK1	P29120	753 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	OPRD1	P41143	372 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	CDR1	P51861	262 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	NCOA4	Q13772	614 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ZNF217	O75362	1048 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	KAT7	O95251	611 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	GNS	P15586	552 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	ITPKA	P23677	461 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TIE1	P35590	1138 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	GRIA2	P42262	883 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	PPP3CC	P48454	512 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	GCLM	P48507	274 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FCHO1-225	ENST00000598539	FMO5	P49326	533 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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