RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598067.5

FCHO1-223, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-223	ENST00000598067	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FCHO1-223	ENST00000598067	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067		A0A1W2PQH9	124 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HMBS	P08397	361 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	KRT13	P13646	458 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TM4SF5	O14894	197 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	KCNK5	O95279	499 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HOXB2	P14652	356 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PTGER3	P43115	390 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	MAPK8	P45983	427 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TUB	P50607	506 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	DPYD	Q12882	1025 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ACOX2	Q99424	681 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	RARG	P13631	454 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TYR	P14679	529 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	P2RY2	P41231	377 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	IRX4	P78413	519 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TAF4B	Q92750	862 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	CD93	Q9NPY3	652 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	ACACB	O00763	2458 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	IKBKB	O14920	756 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	GABRG2	P18507	467 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-223	ENST00000598067	SPINK2	P20155	84 aa		13.8	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms