RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CTHP32929 405 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CCR2P41597 374 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 BPIFB4P59827 614 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 FANCCQ00597 558 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM14Q14142 442 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 STILQ15468 1287 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 WSCD1Q658N2 575 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PMS2CLQ68D20 193 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ELMOD1Q8N336 334 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CXorf38Q8TB03 319 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 RABGGTAQ92696 567 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ABCB6Q9NP58 842 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 EHD2Q9NZN4 543 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 L1RE1Q9UN81 338 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 POLIQ9UNA4 740 aa8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 POLQO75417 2590 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PRRG1O14668 218 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 GABRDO14764 452 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 MOSPD3O75425 235 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 RHOBTB1O94844 696 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 PON1P27169 355 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ASPAP45381 313 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 RNF214Q8ND24 703 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 SPAG5Q96R06 1193 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SYT15Q9BQS2 421 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 CISHQ9NSE2 258 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.25□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GTH6 734 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 ANXA13P27216 316 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 OR1D2P34982 312 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 VIPR2P41587 438 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ALDH1A3P47895 512 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 ARPP19P56211 112 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 SNX16P57768 344 aa8.24□□□□□ -1.09
ZNF548-208ENST00000597576 PTK2Q05397 1052 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZNF548-208ENST00000597576 GPR17Q13304 367 aa8.24□□□□□ -1.09
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