RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596726.3

PNKP-209, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-209ENST00000596726 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 IER2Q9BTL4 223 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-209ENST00000596726 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 MDM4O15151 490 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GPD2P43304 727 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GALK1P51570 392 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LRRC32Q14392 662 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GAS6Q14393 721 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 NCAPHQ15003 741 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 KRT31Q15323 416 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 HTR3DQ70Z44 454 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 OTUB2Q96DC9 234 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 HSFY1Q96LI6 401 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ACP6Q9NPH0 428 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 MED7O43513 233 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 CYP17A1P05093 508 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GNA15P30679 374 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 RGS7P49802 495 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 MTAPQ13126 283 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 DHCR24Q15392 516 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 VPS16Q9H269 839 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 IRF1P10914 325 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LCP1P13796 627 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 DAOAP59103 153 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 PHOX2BQ99453 314 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.12■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 E7ENQ6 273 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 THAP12O43422 761 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LAMTOR5O43504 91 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 SP9P0CG40 484 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ZNF18P17022 549 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 CLCN1P35523 988 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 USP8P40818 1118 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 OPRD1P41143 372 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 STK32AQ8WU08 396 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 IRGQQ8WZA9 623 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 CD101Q93033 1021 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 EXOC4Q96A65 974 aa22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 STC2O76061 302 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 DRD1P21728 446 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 NBL1P41271 181 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 EFEMP1Q12805 493 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 Q6ZNB5 142 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 Q6ZS52 159 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 MIB1Q86YT6 1006 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.1■■□□□ 1.13
PNKP-209ENST00000596726 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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