RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM270Q6UE05 265 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PIGZQ86VD9 579 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MLKLQ8NB16 471 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 UBA3Q8TBC4 463 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GBP4Q96PP9 640 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RAB23Q9ULC3 237 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EML5Q05BV3 1969 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MDM4O15151 490 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PMM2O15305 246 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CYP17A1P05093 508 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TPM2P07951 284 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PAEPP09466 180 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ADH5P11766 374 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KRT5P13647 590 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G4AP47712 749 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TKTL1P51854 596 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BCAT1P54687 386 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SEC13P55735 322 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GAD2Q05329 585 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PDE4CQ08493 712 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LPAL2Q16609 132 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LONP2Q86WA8 852 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MIB1Q86YT6 1006 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NAT16Q8N8M0 369 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RUBCNQ92622 972 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KAT5Q92993 513 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 OTUB2Q96DC9 234 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PNKPQ96T60 521 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NMUR1Q9HB89 426 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CYLDQ9NQC7 956 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 OSER1Q9NX31 292 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NCDNQ9UBB6 729 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DACH1Q9UI36 760 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ESPNB1AK53 854 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ZBED1O96006 694 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 APODP05090 189 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HMBSP08397 361 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LCP1P13796 627 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 USP8P40818 1118 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 OPRD1P41143 372 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A11P48066 632 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EMP3P54852 163 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 COG7P83436 770 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DMWDQ09019 674 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EFEMP1Q12805 493 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf27AQ580R0 203 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HTR3DQ70Z44 454 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CEP68Q76N32 757 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SCD5Q86SK9 330 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TTC30AQ86WT1 665 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms