RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-223ENST00000577256 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG13-223ENST00000577256 FANCLQ9NW38 375 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG13-223ENST00000577256 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG13-223ENST00000577256 LAMTOR5O43504 91 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CALCAP01258 141 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PTMSP20962 102 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 GNA15P30679 374 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 USP8P40818 1118 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 KRT31Q15323 416 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CHFRQ96EP1 664 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 HSFY1Q96LI6 401 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DNAJC12Q9UKB3 198 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BECN2A8MW95 431 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 THAP12O43422 761 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ADH1CP00326 375 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CYP17A1P05093 508 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 IRF1P10914 325 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CCINQ13939 588 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PMF1Q6P1K2 205 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ZNF606Q8WXB4 792 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.5■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MDM4O15151 490 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FBXO21O94952 628 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 LCP1P13796 627 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DRD1P21728 446 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RGS7P49802 495 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 COG7P83436 770 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PTK2Q05397 1052 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 KCNMA1Q12791 1236 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MTAPQ13126 283 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DHCR24Q15392 516 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 HTR3DQ70Z44 454 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CD101Q93033 1021 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 VPS16Q9H269 839 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 GPD2P43304 727 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ACADSBP45954 432 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 GALK1P51570 392 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DAOAP59103 153 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 EFEMP1Q12805 493 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MIB1Q86YT6 1006 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 STK32AQ8WU08 396 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 IRGQQ8WZA9 623 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 WBP2Q969T9 261 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 E7ENQ6 273 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 SART1O43290 800 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 GREM1O60565 184 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ADH5P11766 374 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 CCR3P51677 355 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BPIFB4P59827 614 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 PPP2R5DQ14738 602 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 NCAPHQ15003 741 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 FBXO43Q4G163 708 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 RNF139Q8WU17 664 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG13-223ENST00000577256 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms