RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 C2orf81A6NN90 581 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 F5H6K3 240 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZNF682O95780 498 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ARFIP2P53365 341 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 KLRC3Q07444 240 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 WDR41Q9HAD4 459 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FANCEQ9HB96 536 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NEK6Q9HC98 313 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PARVAQ9NVD7 372 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DPEP1P16444 411 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SCP2P22307 547 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 JAK1P23458 1154 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 EMBQ6PCB8 327 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PROSER1Q86XN7 944 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PSMD9O00233 223 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GPR182O15218 404 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 HAUS5O94927 633 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TFPIP10646 304 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MTFR1Q15390 333 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CDK20Q8IZL9 346 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CD248Q9HCU0 757 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 STK36Q9NRP7 1315 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RAD51CO43502 376 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 KCNJ1P48048 391 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 COG2Q14746 738 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MED15Q96RN5 788 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ECSITQ9BQ95 431 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RNF19AQ9NV58 838 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 IDH3BO43837 385 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RHOCP08134 193 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SUSD6Q92537 303 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RNF31Q96EP0 1072 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PLA2G4AP47712 749 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RNF121Q9H920 327 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MBD5Q9P267 1494 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 AIM2O14862 343 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OR7A10O76100 309 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ANXA5P08758 320 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 STX3Q13277 289 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 STX12Q86Y82 276 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.7□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PLA2R1Q13018 1463 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 A0A096LPK6 155 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 RTN2O75298 545 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OXCT1P55809 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RBP5P82980 135 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 KRT76Q01546 638 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAXCQ5TGI0 409 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 LDHDQ86WU2 507 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.69□□□□□ -1.02
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