RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0U1RQF3 1178 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CAPN8A6NHC0 703 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 M0R2C6 588 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 GPR32O75388 356 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 THBDP07204 575 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CD59P13987 128 aa5.04□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 BCKDHBP21953 392 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 VIPR2P41587 438 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 GLUD2P49448 558 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CXADRP78310 365 aa5.04□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 MBLAC2Q68D91 279 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 VITQ6UXI7 678 aa5.04□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA25Q9BR10 227 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CAPN10Q9HC96 672 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 MARCH5Q9NX47 278 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 DPP7Q9UHL4 492 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PNMA2Q9UL42 364 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 ICE1Q9Y2F5 2266 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 BSNQ9UPA5 3926 aa5.04□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 NF1P21359 2839 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SH3D21A4FU49 640 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 GPAA1O43292 621 aa5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 GRM4Q14833 912 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 INF2Q27J81 1249 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 ODR4Q5SWX8 454 aa5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PMS2CLQ68D20 193 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 NOX5Q96PH1 765 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 SNTG2Q9NY99 539 aa5.03□□□□□ -1.6
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TMOD3-210ENST00000561408 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD3-210ENST00000561408 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.02□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ARNTLO00327 626 aa5.02□□□□□ -1.61
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TMOD3-210ENST00000561408 ZNF263O14978 683 aa5.02□□□□□ -1.61
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TMOD3-210ENST00000561408 POMCP01189 267 aa5.02□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CFIP05156 583 aa5.02□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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